完美生科院再度榮獲軟著證書,自研轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析軟件
近期,完美生科院自主研發(fā)的二代轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)分析軟件“TransAnalyzer”成功獲得國家軟件著作權(quán)證書。
這是繼前兩款軟件 (點擊查看) 之后,生科院獲得的第三個自主研發(fā)軟件的軟著證書,標(biāo)志著生科院在生物信息學(xué)分析領(lǐng)域取得了新的突破,為后續(xù)科研和產(chǎn)品開發(fā)提供了強有力的技術(shù)支持。
軟著證書
轉(zhuǎn)錄組(Transcriptome)廣義上指細(xì)胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的集合,包括信使RNA、核糖體RNA、轉(zhuǎn)運RNA及非編碼RNA等。作為基因表達的中間產(chǎn)物,轉(zhuǎn)錄組不僅搭建了基因組與蛋白質(zhì)組之間的橋梁,更是生命活動調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中不可或缺的一環(huán)。
轉(zhuǎn)錄組學(xué)關(guān)注的是基因轉(zhuǎn)錄成RNA的過程以及轉(zhuǎn)錄后的調(diào)控機制,即基因表達的“第一步”及其后續(xù)調(diào)控。通過轉(zhuǎn)錄組,完美可以揭示基因表達調(diào)控的整體特征,發(fā)現(xiàn)生物學(xué)過程相關(guān)的分子作用機理,以及查找具有特殊功能的基因。
轉(zhuǎn)錄組測序(RNA-seq)技術(shù)的出現(xiàn),為轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究帶來了革命性的突破。這一基于高通量測序的方法,能夠系統(tǒng)地解析細(xì)胞或組織中的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物,全面揭示基因轉(zhuǎn)錄水平的微妙變化,并繪制出復(fù)雜的生物學(xué)通路與性狀調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的精細(xì)圖譜。
轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)[1]
近日,瑞典卡羅琳醫(yī)學(xué)院宣布了一項令人矚目的決定:將2024年諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎的殊榮授予維克托·安布羅斯 (Victor Ambros) 教授與加里·魯夫昆 (Gary Ruvkun) 教授,以表彰他們在microRNA (miRNA) 領(lǐng)域的開創(chuàng)性發(fā)現(xiàn)及其對轉(zhuǎn)錄后基因調(diào)控機制的深刻洞察。
miRNA作為轉(zhuǎn)錄組中的一類非編碼RNA,通過轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)的精確捕獲及轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析,得以在細(xì)胞的微觀層面展現(xiàn)其調(diào)控基因的神奇作用,為非編碼區(qū)域的功能研究開辟了全新的視野。
來源:諾貝爾獎官方
轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究的精髓在于其能夠敏銳地捕捉到轉(zhuǎn)錄組隨著環(huán)境條件、生物體發(fā)育階段以及不同組織與細(xì)胞間的差異所展現(xiàn)出的動態(tài)變化。
無論是成熟線蟲與幼蟲之間的差異,還是藥物干預(yù)前后細(xì)胞狀態(tài)的顯著轉(zhuǎn)變,轉(zhuǎn)錄組都以其獨特的方式記錄并反映這些變化。通過分析在特定時間與特定條件下細(xì)胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄本的差異表達信息,轉(zhuǎn)錄組學(xué)得以全面揭示基因表達調(diào)控的整體特征,深入剖析了基因表達水平的動態(tài)波動以及基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的復(fù)雜性與靈活性。
因此,轉(zhuǎn)錄組學(xué)不僅是理解生命現(xiàn)象的重要工具,更是探索基因功能、解析生物體適應(yīng)機制及疾病發(fā)生發(fā)展的關(guān)鍵途徑。
在保健食品與化妝品研發(fā)領(lǐng)域,轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)成為革新動力,為產(chǎn)品開拓了新的研發(fā)路徑與可能性。
健康食品領(lǐng)域
轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)可以深入探索生物活性化合物與實現(xiàn)膳食營養(yǎng)功能相關(guān)的基因,揭示食品中生物活性化合物對人體健康的潛在效益,從而推動新型保健食品的創(chuàng)新與開發(fā)。
例如,完美運用轉(zhuǎn)錄組學(xué)和代謝組學(xué)技術(shù)成功揭示了“桑葉沙棘蛋白肽”促進大鼠體重減輕以及改善非酒精性脂肪肝的機制。
化妝品領(lǐng)域
借助轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù),完美可以對化妝品原料的功效及其相關(guān)分子機制進行全面分析,深度挖掘原料的潛在功效,為化妝品新產(chǎn)品的開發(fā)提供堅實的科學(xué)理論依據(jù)。
產(chǎn)品安全性評估
保健食品和化妝品中的活性成分可影響細(xì)胞基因表達調(diào)控。
轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析能夠剖析這些成分的作用機制,篩選有效成分,并進行安全性評估,確保產(chǎn)品在實際應(yīng)用中的安全可靠性。
為了更高效、準(zhǔn)確地解讀和分析轉(zhuǎn)錄組測序產(chǎn)生的海量數(shù)據(jù),生科院生物信息學(xué)團隊開發(fā)了分析軟件“TransAnalyzer”,具備以下特點和性能:
√ 先進算法與最新數(shù)據(jù)庫:
軟件結(jié)合了穩(wěn)定先進的算法和最新數(shù)據(jù)庫,為研究人員提供了強大的數(shù)據(jù)分析支持。
√ 全流程集成:
能夠完成原始下機數(shù)據(jù)的質(zhì)量控制、轉(zhuǎn)錄本比對、差異基因注釋以及基因功能注釋等全面分析。
√ 準(zhǔn)確性和可靠性:
通過與多家第三方實驗室比對,軟件的準(zhǔn)確性和可靠性得到了充分證明。
√高效批量處理:
軟件已部署于完美生物信息學(xué)專用高性能服務(wù)器集群上,可實現(xiàn)成百上千個原始數(shù)據(jù)的批量分析,極大地提高了分析效率。
此次“TransAnalyzer”軟件的成功研發(fā)并獲得軟著證書,是完美生科院在生物信息學(xué)領(lǐng)域取得的又一重要成果。
該軟件將為保健食品和化妝品的研發(fā)提供更為科學(xué)、準(zhǔn)確的數(shù)據(jù)支持,助力提升產(chǎn)品效能。未來,生科院將繼續(xù)秉承創(chuàng)新精神,不斷深化轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)的研究與應(yīng)用,為科學(xué)研究賦能產(chǎn)品打下更堅實的基礎(chǔ)。
相信在不久的將來,更多具有創(chuàng)新性和實用性的科研成果將從生科院誕生,為人類健康和美麗事業(yè)貢獻更多力量。
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